Olá Alan,
Você pode fazer com que ele apague o e-mail ou mova para alguma outra pasta. Depende da configuração do seu canal de comunicação do tipo MAIL Sender. Aqui no cliente que estou optamos por fazer usando protocolo de transporte POP3 e não iremos manter a mensagem na caixa, mas via IMAP4 sei que tem uma propriedade que você poderá mover esse e-mail para uma outra pasta. O canal até onde eu sei irá ler todos os e-mails da caixa de entrada.
Att,
Gabriela